漫威蜘蛛侠：复制版PC许多版本已经正式发布，许多版本已经正式发布Mod作者还发布了游戏修复、替换或恶搞Mod。但是最近有一个Mod但在网上引起争议，Mod作者Mike Hawk上传了Mod“Non-Newtonian New York”，加载这款Mod之后，游戏中的同性恋彩虹旗可以用美国国旗代替。

在这款Mod在页面叙述中，作者讽刺地说，《漫威蜘蛛侠：复制版》中彩虹旗太多，评论区有很多人同意，还有恐同言论，导致了这一点Mod网上有争议。很多人指责这个。Mod作者涉嫌歧视LGBT群体。

之后这款Mod被NexusMods网站下架，Mike Hawk也被永久封号。NexusMods官方认为该用户是在故意捣乱，上传Mod意图反对包容性/多样性。官方表示：“我们的网站不允许这样的事情发生，所以我们采取了行动。我们不想和人争论这个问题。如果我们网站的政策让你不开心，可以自己删除账号。”